科研队伍
基本信息
姓名: 黄艳新
性别: 
职称: 
教授
出生年月: 
1967-03
专业: 
计算机技术应用
办公电话: 
0431-85099502
传真: 
0431-85099502
个人概况: 
毕业于吉林大学,东北师范大学生命科学学院教授、博士生导师。技术方向:①细胞生物信息学和系统生物学;②计算机辅助药物分子设计。
个人情况综述: 

主要研究方向

技术方向:细胞生物信息学(免疫信息学)和系统生物学;计算机辅助药物分子设计。

研究目标:抗肿瘤和抗糖尿病药物分子筛选及其细胞作用机制研究。

招生意向:招收生物学、生物信息学、理论化学、药物化学、数学和计算机科学等专业背景,以计算和生物学实验相结合进行科学研究的硕士、博士研究生(最好能硕博连读)。同时欢迎其它院校以上学科背景的保送研究生和调剂研究生。

主要学习简历

1985.9-1989.7 北京理工大学应用数学系应用数学专业 本科生

1996.9-1999.3 长春理工大学计算机学院计算机应用专业 硕士研究生

2001.9-2004.12 吉林大学计算机科学与技术学院计算机应用技术专业 博士研究生

主要工作简历

1989.7-1996.8 长春第一汽车制造厂 助理工程师

1993.3-1994.5 日本共和电脑株式会社、日本富士通株式会社 工作、研修

1999.3-2009.4 吉林大学计算机科学与技术学院 讲师、副教授

2006.12-2008.12 东北师范大学遗传与细胞研究所 博士后

2009.4至今 东北师范大学生命科学学院 药物基因和蛋白筛选国家工程实验室 副教授、教授

科研项目

[1]药物计算与实验筛选产学研联盟科技创新攻关平台. 长春市科技计划项目(12ZX55). 项目负责人.

[2]通过基因芯片数据分析与系统生物学建模方法识别诱导癌细胞凋亡药物靶标. 省科技厅自然科学基金项目(20130101148JC). 项目负责人.

[3]细胞凋亡信号转导网络多尺度建模及其在新抗肿瘤药物靶标识别方面的应用研究. 国家自然科学基金项目(61172183). 项目负责人.

[4]基于药效团和定量构效关系模型的计算机虚拟筛选平台. 吉林省中医药管理局资助项目(2011-zd16). 项目负责人.

[5]中药有效成分和药物分子作用靶标的计算机虚拟筛选. 吉林省中医药管理局资助项目(2010pt067).项目负责人.

[6]细胞凋亡信号转导网络的计算建模研究(20101503),省科技厅自然科学基金项目,项目负责人.

[7]基于噬菌体展示库的B细胞构象性表位预测算法及其应用研究(20080431048),中国博士后科学基金项目,项目负责人.

主要研究成果(代表性论文,*为通讯作者)

[1]Huang YX*Zhao JSong QHZheng LHFan CLiu TTBao YLSun LGZhang LB*Li YX4*. Virtual screening and experimental validation of novel histone deacetylase inhibitors. BMC Pharmacol Toxicol. 2016 Jul 21;17(1):32.

[2]Wang HYHuang YX*Zheng LHBao YLSun LGWu YYu CLSong ZBSun YWang GNMa ZQLi YX*. Modelling coupled oscillations in the Notch, Wnt, and FGF signaling pathways during somitogenesis: acomprehensive mathematical model. Comput Intell Neurosci. 2015;2015:387409. doi: 10.1155/2015/387409.

[3]Qi YFHuang YX*Dong YZheng LHBao YLSun LGWu YYu CLJiang HYLi YX*. Systematic analysis of time-series gene expression data on tumor cell-selective apoptotic responses to HDACinhibitors. Comput Math Methods Med. 2014;2014:867289. doi: 10.1155/2014/867289.

[4]Wang HY, Huang YX*, Qi YF, Zhang Y, Bao YL, Sun LG, Zheng LH, Zhang YW, Ma ZQ*, Li YX*. Mathematical models for the Notch and Wnt signaling pathways and the crosstalk between them during somitogenesis. Theor Biol Med Model. 2013; 10(1): 27.

[5]YF Qi, YX Huang*, HY Wang, Y Zhang, YL Bao, LG Sun, Y Wu, CL Yu, ZB Song, LH Zheng, Y Sun, GN Wang, YX Li*. Elucidating the crosstalk mechanism between IFN-gamma and IL-6 via mathematical modelling. BMC Bioinformatics. 2013, 14(1): 41.

[6]J Huang*, Ratmir Derda, YX Huang. Phage Display Informatics. Comput Math Method M. vol 2013, pp: 698395.

[7]C Fan, YX Huang*, YL Bao*, LG Sun, Y Wu, CL Yu, Y Zhang, ZB Song, LH Zheng, Y Sun, GN Wang, YX Li*. Virtual Screening of Specific Insulin-Like Growth Factor 1 Receptor (IGF1R) Inhibitors from the National Cancer Institute (NCI) Molecular Database. INT J MOL SCI. 2012, 13(12), 17185-17209.

[8]YX Sun, YX Huang*, FL Li, HY Wang, C Fan, YL Bao, LG Sun, ZQ Ma, J Kong*, YX Li*. IVSPlat 1.0: an integrated virtual screening platform with a molecular graphical interface. CHEM CENT J. 2012, 6:2.

[9]WH Chen, WW Guo, YX Huang*, ZQ Ma*. PepMapper: A Collaborative Web Tool for Mapping Epitopes from Affinity-Selected Peptides. PLoS ONE 2012, 7(5): e37869.

[10]XW Zhao, JK Li, YX Huang*, ZQ Ma*, MH Yin*. Prediction of Bioluminescent Proteins Using Auto Covariance Transformation of Evolutional Profiles. INT J MOL SCI. 2012, 13(3), 3650-3660.

[11]ZL Cao, JZ Meng, XX Li, RP Wu, YX Huang, YX He*. The Epitope and Neutralization Mechanism of AVFluIgG01, a Broad-Reactive Human Monoclonal Antibody against H5N1 Influenza Virus. PLoS ONE 2012, 7(5): e38126.

[12]M Zheng, JN Wu, YX Huang, GX Liu, Y Zhou*, CG Zhou. Inferring Gene Regulatory Networks by Singular Value Decomposition and Gravitation Field Algorithm. PLoS ONE 2012, 7(12): e51141.

[13]M Zheng, YX Huang, W Shen, Y Zhong, JN Wu, GX Liu*, Y Zhou*. A novel scale-free network construction method and its application in gene expression profiles simulation. PROG BIOCHEM BIOPHYS. 2012, 39(6): 581-590.

[14]PP Sun, WH Chen, YX Huang*, HY Wang, ZQ Ma*, YH Lv*. Epitope prediction based on random peptide library screening: Benchmark datasets and prediction tools evaluation. Molecules 2011; 16(6): 4971-4993.

[15]WH Chen, PP Sun, Y Lu, WW Guo, YX Huang*, ZQ Ma*. MimoPro. a more efficient Web-based tool for epitope prediction using phage display libraries. BMC Bioinformatics 2011; 12: 199.

[16]YX Huang, YL Bao*, SY Guo, Y Wang, CG Zhou, YX Li*. Pep-3D-Search: a method for B-cell epitope prediction based on mimotope analysis. BMC Bioinformatics, 2008, 9:538.

[17]黄艳新, 鲍永利*, 李玉新*. 抗原表位预测的免疫信息学方法研究进展. 中国免疫学杂志, 2008, Vol 24, No 9, pp 857-861.